Gli organi di indirizzo politico e amministrativo sono :

- l'Autorità di Bacino Lacuale dei Laghi d'Iseo, Endine e Moro, Socio Unico

- Il Presidente del Consiglio di Amministrazione

- il Consiglio di Amministrazione

- il Comitato di Indirizzo e Controllo

- il Revisore Legale

- l'Organismo di Vigilanza (ODV)

- l'Organismo Interno di Valutazione (OIV)